理化指標檢測：
pH、渾濁度、總硬度、溶解性總固體、總堿度、SS、色度、磷酸鹽、苯系物(BTEX)、臭味、水溫、電導率、懸浮性固體、總氮、總有機碳、溶解氧、石油類和動植物油、陰離子表面活性劑等
無機陰離子檢測：
硫酸鹽、氰化物、氟化物、氯化物、溴化物、碘化物、碳酸鹽、重碳酸鹽等。
營養鹽及有機指標檢測：
氨氮、高錳酸鹽指數、化學需氧量（CODCr）、生化需氧量（BOD5）、硝酸鹽（以N計）、亞硝酸鹽(以N計)等。
金屬含量檢測：
砷、汞、六價鉻、鉛、鋅、銅、鎘、鐵、錳、鈷、鎳、鉬、鈹、鋇、鉀、鈉、鈣、鎂等。
微生物檢測：
總大腸菌群、菌落總數、耐熱大腸菌群、大腸埃希氏菌、金黃色葡萄球菌等。
有機污染物檢測：
肉眼可見物、揮發酚、多環芳烴(PAH)、多氯聯苯(PCBs)、可吸附有機鹵化物、揮發性鹵代烴、有機氯農藥(OC Pesticides)、有機磷農藥(OP Pesticides)、揮發性有機物(VOCs)、半揮發性有機物(SVOCs)、二噁英、 總石油烴類(TPH)等。